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Quantum Curve Version 0.1.1 更新说明

仅供参考

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  1. 更新了右键移动的交互方式,之前的版本中会导致移动后奇怪的旋转中心。Ctrl + 右键的逻辑没有更改。

  2. 支持了从ORCA的.out/.hess文件中中读取振动频率信息和结构信息,可以在Results-IR中查看。支持输出频率文件为.txt/.csv文件。

  3. 支持了Gaussian的输出文件.out/.log中读取频率信息和结构信息。

  4. 支持了从ORCA的.out文件中提取结构优化中每一步的结构信息。

  5. 支持了从ORCA的.molden文件(由.gbw文件产生)中读取信息,并产生对应的HOMO/LUMO轨道信息为.cube文件。

  6. 支持了从.cif文件中读取结构信息和晶胞信息,并可以在面板中修改晶胞参数。支持输出文件为.cif文件。支持带有结构信息的.gjf文件与.cif文件的相互转换。

  7. 支持了从ORCA/Gaussian的输出文件中结构优化过程中提取能量变化情况。

  8. 碳原子的标签修改为白色。

  9. 新增棍模型和线模型。支持了化学键的着色开关,开启后将按照临近原子的着色来渲染化学键的颜色。

  10. 支持了将渲染区域的内容输出为.jpg/.svg/.pdf。

  11. 支持了修改渲染区的背景颜色。

  12. 实现了从POSCAR/STRU/.wfn/.wfx文件中读取化学结构信息。

  13. 实现从QE的.in文件中读取化学结构信息。

  14. 支持Gaussian/ORCA中的幽灵原子的可视化。元素周期表中添加了幽灵原子。

  15. 支持了修改应用的字体。

  16. 支持了SSH连接远程服务器。

  17. 剩下的懒得写了。

⚠️注意:

  1. .cif文件的读取依然存在问题。特别是一些棘手的地方,例如某个碳原子的位置并不准确,有两个可能的位置。而原始数据中的占据数均为1,那么解析出来的坐标可能是含有重复原子的结构。
  2. ORCA面板的输入暂未完善还有较大缺失。

以下是目前版本支持读取/输入的文件类型:

V 0.1.1FormatAtom coordinates (I/O)CellVibrations (I)Optimization (I)GTFsVersion
 .xyz✅/✅    Beta
 .mol✅/❌    Beta
 .mol2✅/❌    Beta
 .pdb✅/✅    Beta
 .cif✅/✅   Beta
 .cube/.cub✅/❌    Beta
 .wfn✅/❌    Beta
ORCA.inp✅/✅    Beta
ORCA.out✅/❌  Beta
ORCA.hess✅/❌   Beta
ORCA.molden/.input✅/❌   Beta
Gaussian.gjf✅/✅   Beta
Gaussian.out/.log✅/❌  Beta
Gaussian.fch/.fchk✅/❌   Beta
Gaussian.wfx✅/❌    Beta
MOPAC.mop✅/❌    Beta
PSI4.inp✅/❌    Beta
CP2K.inp/.restart✅/❌   Beta
QE.in✅/❌   Beta
VASPPOSCAR✅/✅   Beta
ABACUSSTRU✅/❌   Beta
        

⚠️这个版本支持了渲染HOMO/LUMO轨道,但依然属于早期版本。可以载入Gaussian产生的.fch/.fchk文件和ORCA产生的.molden/.input文件。ORCA产生.molden/.input文件的方法为,在filename.gbw文件所在路径下使用命令: orca_2mkl filename -molden 即可以得到filename.molden.input文件。如果你不喜欢Quantum Curve产生的HOMO/LUMO填色图,可以导出为.cube然后导入到其他程序中,例如VESTA。

⚠️这个版本同样支持.xyz的多帧文件,但优化了一些布局页面。

⚠️这个版本绘制IR图谱所用的FWHM为10。

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